Resposta:

“Refratar” vem do Latim REFRACTIO, “quebra”, de REFRACTUS, particípio passado de REFRINGERE, “romper, quebrar”, de RE-, “de novo”, mais FRANGERE, “partir, quebrar”.

Olhe  a origem de “reflexão” na Lista de Palavras.

Quanto à diferença entre elas, um dicionário o orientará.