Resposta:

“União” vem de uma palavra Indoeuropéia OINOS, através do Latim UNUS, “um”. Daqui vieram igualmente “único”, “reunir”, “onça” (a medida de peso, não o felino!), “inch” (“polegada” em Inglês).
Já “separação” vem do Latim SEPARARE, composto por SE, “afastar” e PARARE, “preparar previamente, tornar pronto, prover”. Queria dizer “preparar à parte”.
Qualquer união tem ante si a possibilidade da separação.