Resposta:

Airton:

Essa sua dúvida só acontece com quem conhece Etimologia.
Não, esse encontro “GN” faz parte de uma das palavras latinas que compõem “persignar”.
A primeira é PER-, “através”, e a outra é SIGNUM, “marca, sinal, símbolo”.
E esta vem do Indo-Europeu SEKW-, “apontar, localizar”.