Resposta:

Ela vem do Latim DISCIPLINA, “instrução dada a um discípulo”; esta última vem de DISCIPULUS, “aluno, aquele que aprende”, do verbo DISCIPERE, “apreender intelectualmente, analisar”, formado por DIS-, “fora”, mais CAPERE, “pegar, agarrar”.
Sua aplicação original é a que citamos; o sentido de “correção por meio de punição” é posterior.