Resposta:

Embora se trate de um título tão conhecido, suas origens ainda são discutidas. O consenso geral aponta para o Latim, de PONS, “ponte” (originalmente “caminho”), mais FACERE, “fazer”. 

O Pontífice  era o título mais elevado do Colégio Pontifical, sendo considerado a posição mais alta na religião romana. Isso levou alguns a dizerem que o nome do cargo deriva do fato de ele fazer uma ligação, uma “ponte” entre as pessoas e as divindades.

Parece mais provável que, na visão da época, só uma pessoa com poderes religiosos elevados é que teria o poder de providenciar meios de se cruzar os rios, dos quais muitos eram considerados divindades.