Resposta:

Ela foi criada ao redor de 1971, juntando as palavras “homossexual”, que significa “pessoa que sente atração por outras do mesmo sexo” e “fobia”, “aversão”, do Grego PHOBOS, “medo”.

A palavra acabou sendo usada tal como está, mas etimologicamente quer dizer “aversão ao mesmo”, o que não faz sentido. Provavelmente o sujeito que a inventou não era muito bom com palavras.